RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOX13Q9UN79 622 aa8.26□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 SSFA2P28290 1259 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 CABP4P57796 275 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 NFIAQ12857 509 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 C8orf34Q49A92 452 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPR3P17342 541 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 PMEPA1Q969W9 287 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 NCOA2Q15596 1464 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ABCC2Q92887 1545 aa8.24□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 UACAQ9BZF9 1416 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF14Q15058 1648 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 HMX2A2RU54 273 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 COBLO75128 1261 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 PREPP48147 710 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLRP12P59046 1061 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTMR3Q13615 1198 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF43Q68DV7 783 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF208Q9H0X6 261 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLIQ9UNA4 740 aa8.23□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 EREGO14944 169 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 HGSNATQ68CP4 663 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCTP1Q6DN14 999 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 NXPE3Q969Y0 559 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.22□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP10BO94823 1461 aa8.21□□□□□ -1.09
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRR19A6NJB7 356 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNFRSF21O75509 655 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTC16Q8NEE8 873 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 OSMRQ99650 979 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.21□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 MEGF11A6BM72 1044 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 BMP3P12645 472 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITGAEP38570 1179 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 BSNDQ8WZ55 320 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGEF11O15085 1522 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHACTR2O75167 634 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPINK2P20155 84 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 BEND4Q6ZU67 534 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FZD6O60353 706 aa8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 EDN3P14138 238 aa8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL4DP49703 201 aa8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FDX2Q6P4F2 183 aa8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.18□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAMTS4O75173 837 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM13AO94988 1023 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 EHHADHQ08426 723 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 IKBKEQ14164 716 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 GRIK1P39086 918 aa8.16□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 USP5P45974 858 aa8.16□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
USP3-AS1-202ENST00000559357 DTX1Q86Y01 620 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms