RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC6O95255 1503 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CRB1P82279 1406 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 GCP02774 474 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 FGFR3P22607 806 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 CDCA8Q53HL2 280 aa5.91□□□□□ -1.46
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TMOD3-204ENST00000558666 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 SERPINA10Q9UK55 444 aa5.91□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
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TMOD3-204ENST00000558666 C1orf53Q5VUE5 145 aa5.9□□□□□ -1.46
TMOD3-204ENST00000558666 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa5.9□□□□□ -1.46
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TMOD3-204ENST00000558666 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.9□□□□□ -1.46
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TMOD3-204ENST00000558666 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.9□□□□□ -1.46
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TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.9□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.9□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 NINLQ9Y2I6 1382 aa5.9□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF15O94989 841 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 ATG7O95352 703 aa5.89□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 TNS2Q63HR2 1409 aa5.89□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.88□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.88□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.88□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
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TMOD3-204ENST00000558666 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 C4AP0C0L4 1744 aa5.87□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 C4BP0C0L5 1744 aa5.87□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TMOD3-204ENST00000558666 QSER1Q2KHR3 1735 aa5.86□□□□□ -1.47
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