RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.63□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.63□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 MED26O95402 600 aa9.62□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 ORC1Q13415 861 aa9.62□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.62□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF576Q9H609 170 aa9.62□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR182O15218 404 aa9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 SPINK2P20155 84 aa9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 SGO2Q562F6 1265 aa9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GNPTAB-208ENST00000550718 DTX1Q86Y01 620 aa9.61□□□□□ -0.87
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GNPTAB-208ENST00000550718 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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GNPTAB-208ENST00000550718 PAOXQ6QHF9 649 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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GNPTAB-208ENST00000550718 ABCB6Q9NP58 842 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 BRD1O95696 1058 aa9.57□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 RXRBP28702 533 aa9.57□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 AP3B2Q13367 1082 aa9.57□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 TMC1Q8TDI8 760 aa9.57□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.57□□□□□ -0.88
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GNPTAB-208ENST00000550718 CORO1BQ9BR76 489 aa9.57□□□□□ -0.88
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GNPTAB-208ENST00000550718 WDR64B1ANS9 1081 aa9.56□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.56□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 ATG3Q9NT62 314 aa9.56□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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GNPTAB-208ENST00000550718 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.55□□□□□ -0.88
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GNPTAB-208ENST00000550718 WNT11O96014 354 aa9.53□□□□□ -0.88
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GNPTAB-208ENST00000550718 MAP7Q14244 749 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 NFKBIBQ15653 356 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 MCTP1Q6DN14 999 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 ZAR1Q86SH2 424 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.53□□□□□ -0.88
GNPTAB-208ENST00000550718 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 GRM2Q14416 872 aa9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 RAD18Q9NS91 495 aa9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.52□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.51□□□□□ -0.89
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GNPTAB-208ENST00000550718 TMC7Q7Z402 723 aa9.51□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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GNPTAB-208ENST00000550718 MSMPQ1L6U9 139 aa9.5□□□□□ -0.89
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GNPTAB-208ENST00000550718 GATA6Q92908 595 aa9.5□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.5□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.5□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAMTS4O75173 837 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 ECEL1O95672 775 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 PRNPP04156 253 aa9.49□□□□□ -0.89
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GNPTAB-208ENST00000550718 CYP27A1Q02318 531 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 DSC3Q14574 896 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 WDR18Q9BV38 432 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 KRT82Q9NSB4 513 aa9.49□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 TREHO43280 583 aa9.48□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GNPTAB-208ENST00000550718 FAAP100Q0VG06 881 aa9.48□□□□□ -0.89
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