RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 MYH7P12883 1935 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SBF2Q86WG5 1849 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 UBE4AQ14139 1066 aa24.74■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SMIM22K7EJ46 135 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SCN7AQ01118 1682 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CYP7A1P22680 504 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 NCOA7Q8NI08 942 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SYCE3A1L190 88 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 B4E1Z4 1266 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 PROM2Q8N271 834 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SENP2Q9HC62 589 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 C4BP0C0L5 1744 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 MCM5P33992 734 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CNBD1Q8NA66 436 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 LAMB2P55268 1798 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 GUCY1B3Q02153 619 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 GYS1P13807 737 aa24.7■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 RXRAP19793 462 aa24.7■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.7■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 NAPBQ9H115 298 aa24.7■■□□□ 1.55
PRDM4-205ENST00000550376 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.7■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 NEDD4P46934 1319 aa24.7■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.7■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 PDCP20941 246 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 MRE11P49959 708 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF384Q8TF68 577 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 LY75O60449 1722 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 KDM4AO75164 1064 aa24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 TRDNQ13061 729 aa24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 H3BQV1 296 aa24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 IFFO2Q5TF58 517 aa24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.68■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 TDO2P48775 406 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 CASZ1Q86V15 1759 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 RGL2O15211 777 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 TOMM22Q9NS69 142 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.67■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 MBD3O95983 291 aa24.66■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.66■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.66■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 TXNRD1Q16881 649 aa24.65■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.65■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 SERPINB2P05120 415 aa24.65■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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PRDM4-205ENST00000550376 C4AP0C0L4 1744 aa24.64■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.64■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF445P59923 1031 aa24.64■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 TTC6Q86TZ1 520 aa24.64■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.64■■□□□ 1.54
PRDM4-205ENST00000550376 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.64■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 PRDX5P30044 214 aa24.64■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.63■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 RBSNQ9H1K0 784 aa24.63■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.63■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 EVX2Q03828 476 aa24.63■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.63■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 DDR1Q08345 913 aa24.62■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.62■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.535e-6■□□□□ 8.8
PRDM4-205ENST00000550376 GRAPQ13588 217 aa24.61■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 ALX1Q15699 326 aa24.61■■□□□ 1.53
PRDM4-205ENST00000550376 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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