RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 ICE2Q659A1 982 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SDE2Q6IQ49 451 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 KANK3Q6NY19 840 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SWAP70Q9UH65 585 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 USP19O94966 1318 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 C6orf229H3BNL8 230 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TULP2O00295 520 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 VAMP4O75379 141 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 IGHDP01880 384 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TDO2P48775 406 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 GNAI1P63096 354 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TCEAL1Q15170 157 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 FAM174AQ8TBP5 190 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 MED4Q9NPJ6 270 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 MAP3K19Q56UN5 1328 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ALS2Q96Q42 1657 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ATP10DQ9P241 1426 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CCDC189A1A4V9 331 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CHL1O00533 1208 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 COQ9O75208 318 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ATG7O95352 703 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TGFB3P10600 412 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 KCNA6P17658 529 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TBX4P57082 545 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 KCNH2Q12809 1159 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TRDNQ13061 729 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PTPRNQ16849 979 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF511Q8NB15 262 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PANK1Q8TE04 598 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PIF1Q9H611 641 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SMC3Q9UQE7 1217 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 TNNQ9UQP3 1299 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 KLHL33A6NCF5 533 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 MSTNO14793 375 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 ADAM23O75077 832 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 VIL1P09327 827 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 FDX1P10109 184 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRB-207ENST00000549400 RPAINQ86UA6 219 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms