RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533409.1

MS4A6A-218, Transcript of membrane spanning 4-domains A6A, human

TSL 3

Gene MS4A6A, Length 682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MS4A6A-218	ENST00000533409	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	PXDN	Q92626	1479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	MYOM1	P52179	1685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409		M0R2N6	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	TSPAN6	O43657	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	NOS2	P35228	1153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	RAB33A	Q14088	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	IFFO2	Q5TF58	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	APPBP2	Q92624	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MS4A6A-218	ENST00000533409	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ESPN	B1AK53	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	KCNQ2	O43526	872 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	LIG1	P18858	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	COL9A1	P20849	921 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	HSPA1L	P34931	641 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	IL13	P35225	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TATDN2	Q93075	761 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	PLIN1	O60240	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	CAND2	O75155	1236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	IL2RB	P14784	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	CD53	P19397	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	IGFBP4	P22692	258 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	FUT2	Q10981	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	JAML	Q86YT9	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	FEZ1	Q99689	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MS4A6A-218	ENST00000533409	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms