RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518426.1

CLVS1-202, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 312 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-202ENST00000518426 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FBXO27Q8NI29 283 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PPT2Q9UMR5 302 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PHF24Q9UPV7 400 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 GPR25O00155 361 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ITGA6P23229 1130 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 MCM4P33991 863 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 RAB33AQ14088 237 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SEPT6Q14141 434 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM182BQ5T319 152 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 RASIP1Q5U651 963 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SYT9Q86SS6 491 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 GMCL1Q96IK5 515 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CBX8Q9HC52 389 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CDC14CA4D256 554 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 KLF4O43474 513 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CPB1P15086 417 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CTBSQ01459 385 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PCDH1Q08174 1060 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TCEAL1Q15170 157 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PCSK7Q16549 785 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 BSNDQ8WZ55 320 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 MKL1Q969V6 931 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SAMM50Q9Y512 469 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 BMP6P22004 513 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 NME2P22392 152 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 MPP2Q14168 576 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLVS1-202ENST00000518426 KANK3Q6NY19 840 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM35AQ86V20 835 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SULF2Q8IWU5 870 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PLD4Q96BZ4 506 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SHDQ96IW2 340 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TRERF1Q96PN7 1200 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CRBNQ96SW2 442 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SNTG2Q9NY99 539 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM177BA6PVY3 158 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PPFIA3O75145 1194 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CLSTN1O94985 981 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 BPNT1O95861 308 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 B3GALT4O96024 378 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 BMP4P12644 408 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 PTPRAP18433 802 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ZNF165P49910 485 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 RASA3Q14644 834 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 LRRC14Q15048 493 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TNNI3KQ59H18 835 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 LLGL2Q6P1M3 1020 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 GK5Q6ZS86 529 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 STK35Q8TDR2 534 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 LRRC3Q9BY71 257 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ST7Q9NRC1 585 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SOX13Q9UN79 622 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM221AA4D161 298 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 FAM221BA6H8Z2 402 aa5.03□□□□□ -1.6
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