RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514232.1

SMARCAD1-208, Transcript of SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1, human

TSL 3

Gene SMARCAD1, Length 444 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCAD1-208	ENST00000514232	AFM	P43652	599 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MYO19	Q96H55	970 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CELA3B	P08861	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RAB6A	P20340	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NFKBIE	O00221	500 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TRIM13	O60858	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IGFBP4	P22692	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ARL4D	P49703	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SCNN1A	P37088	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ALG2	Q9H553	416 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CEACAM5	P06731	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SRF	P11831	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	INSRR	P14616	1297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	OXCT1	P55809	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ACPP	P15309	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZP2	Q05996	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IKBKE	Q14164	716 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LGR5	O75473	907 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ABL2	P42684	1182 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SEC13	P55735	322 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	KCNN1	Q92952	543 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CTSB	P07858	339 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IKZF1	Q13422	519 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ASPA	P45381	313 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZXDA	P98168	799 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FOXO3	O43524	673 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TRPA1	O75762	1119 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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