RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496277.5

CNIH3-211, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH3, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-211ENST00000496277 RAXQ9Y2V3 346 aa7.37□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 FSTP19883 344 aa7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.36□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 TIAF1O95411 115 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 CYP11A1P05108 521 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 POU4F3Q15319 338 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 FBF1Q8TES7 1133 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 STOML1Q9UBI4 398 aa7.35□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 BMP3P12645 472 aa7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 CORO1BQ9BR76 489 aa7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.34□□□□□ -1.23
CNIH3-211ENST00000496277 DRD2P14416 443 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 SGO2Q562F6 1265 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 Q8N3U1 123 aa7.33□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 HMX2A2RU54 273 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ADH5P11766 374 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ATP2B2Q01814 1243 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 AP3B2Q13367 1082 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 BEND4Q6ZU67 534 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.32□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 IGLV1-40P01703 118 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 PDE3AQ14432 1141 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 GSC2O15499 205 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 GSTT1P30711 240 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 NFIAQ12857 509 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 RNF43Q68DV7 783 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 WDR18Q9BV38 432 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 RNF112Q9ULX5 631 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 RXRBP28702 533 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 XP32Q5T750 250 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 STK35Q8TDR2 534 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 RAD18Q9NS91 495 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 SPG7Q9UQ90 795 aa7.28□□□□□ -1.24
CNIH3-211ENST00000496277 AOC2O75106 756 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 FBXO24O75426 580 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 LIG1P18858 919 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 USP11P51784 963 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 PDZD3Q86UT5 571 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 SLC51AQ86UW1 340 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 SULF2Q8IWU5 870 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 C12orf49Q9H741 205 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 GIPC1O14908 333 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 ZNF862O60290 1169 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 TGFB1P01137 390 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 LRP8Q14114 963 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 ARTNQ5T4W7 220 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 DYMQ7RTS9 669 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH3-211ENST00000496277 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms