RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF787Q6DD87 383 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 EPXP11678 715 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 BMP6P22004 513 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 ARNTP27540 789 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SULF2Q8IWU5 870 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT8Q8WV74 236 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 ARL4DP49703 201 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 RBL2Q08999 1139 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 APOBRQ0VD83 1088 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 AP3B2Q13367 1082 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 WNT8BQ93098 351 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 PPME1Q9Y570 386 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 LILRB5O75023 590 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA1P21709 976 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 NKD1Q969G9 470 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 CBX8Q9HC52 389 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 PIP4K2BP78356 416 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 IRF7Q92985 503 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 SOX9P48436 509 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 GINM1Q9NU53 330 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 UBP1Q9NZI7 540 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 MPP2Q14168 576 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 GRIK5Q16478 980 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 DPH6Q7L8W6 267 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC3Q9BY71 257 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS2O95450 1211 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ACDQ96AP0 544 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 BPNT1O95861 308 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 F13A1P00488 732 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ALBP02768 609 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CYP11A1P05108 521 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 GSTM4Q03013 218 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM37O94972 964 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CHSY3Q70JA7 882 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 LNPKQ9C0E8 428 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ERBB4Q15303 1308 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 FAM221AA4D161 298 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 M0R082 166 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CILPO75339 1184 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CDC25BP30305 580 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CRKP46108 304 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 BAG6P46379 1132 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 SEZ6Q53EL9 994 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 RASIP1Q5U651 963 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF417Q8TAU3 575 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 STK35Q8TDR2 534 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01387J3KSC0 135 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 OIP5O43482 229 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF165P49910 485 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT6Q14141 434 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 MSL1Q68DK7 614 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 PDZD3Q86UT5 571 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD6Q96KE9 485 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 CORO1BQ9BR76 489 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRC-212ENST00000491302 FSCN2O14926 492 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRC-212ENST00000491302 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRC-212ENST00000491302 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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