RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 ME3Q16798 604 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 XDHP47989 1333 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 F13A1P00488 732 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 FBXO41Q8TF61 875 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 KLRK1P26718 216 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 USP48Q86UV5 1035 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 ZMYM6O95789 1325 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 A0A0G2JLW4 131 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ZNF213O14771 459 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 BBOX1O75936 387 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ALX1Q15699 326 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 HS1BP3Q53T59 392 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ESPNB1AK53 854 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 Q6ZUG5 572 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 RBSNQ9H1K0 784 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ABCF2Q9UG63 623 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 MBD4O95243 580 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 GNAT2P19087 354 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 GJB2P29033 226 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 RAI14Q9P0K7 980 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 APPP05067 770 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 PDCP20941 246 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 MTMR6Q9Y217 621 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 UBE2HP62256 183 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 TMC4Q7Z404 712 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 TCHHQ07283 1943 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 CYP7A1P22680 504 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 HAND2P61296 217 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 FGD1P98174 961 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ST3GAL1Q11201 340 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ARMT1Q9H993 441 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 SYCE3A1L190 88 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 FBXL16Q8N461 479 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 NECAB1Q8N987 351 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 CACNA1SQ13698 1873 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 ATP2B4P23634 1241 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 NCOA7Q8NI08 942 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-204ENST00000476231 IGSF3O75054 1194 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 GPSM2P81274 684 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 BRF1Q92994 677 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 LCORLQ8N3X6 602 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MMP10P09238 476 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 NAPBQ9H115 298 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 TSPY26PQ9H489 355 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MCM5P33992 734 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 GTF3C6Q969F1 213 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 GGA1Q9UJY5 639 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 PDE6BP35913 854 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 TRDNQ13061 729 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-204ENST00000476231 NBPF3Q9H094 633 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms