RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 COA1Q9GZY4 146 aa24.24■■□□□ 1.47
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HDDC3-202ENST00000394272 FGAP02671 866 aa24.24■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 MECOMQ03112 1051 aa24.24■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 KRT32Q14532 448 aa24.24■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 LAMA4Q16363 1823 aa24.23■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 RIMBP2O15034 1052 aa24.23■■□□□ 1.47
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HDDC3-202ENST00000394272 MCM2P49736 904 aa24.23■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.23■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
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HDDC3-202ENST00000394272 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.23■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 DPEP1P16444 411 aa24.22■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.22■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 LCORLQ8N3X6 602 aa24.22■■□□□ 1.47
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HDDC3-202ENST00000394272 EYA3Q99504 573 aa24.22■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 A0A0G2JLW4 131 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 RUFY3Q7L099 469 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 CPA1P15085 419 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.21■■□□□ 1.47
HDDC3-202ENST00000394272 ZMYM6O95789 1325 aa24.2■■□□□ 1.47
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HDDC3-202ENST00000394272 TGFB2P61812 414 aa24.2■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 ALX1Q15699 326 aa24.2■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.2■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.19■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.18■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.18■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.18■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 NEK1Q96PY6 1258 aa24.18■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.18■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.17■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.17■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 AK2P54819 239 aa24.17■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.16■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF213O14771 459 aa24.15■■□□□ 1.46
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HDDC3-202ENST00000394272 HAND2P61296 217 aa24.15■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 GTF2IP78347 998 aa24.15■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 PODNQ7Z5L7 613 aa24.15■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC93Q567U6 631 aa24.14■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 SCN9AQ15858 1988 aa24.14■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.13■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.13■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 NBPF3Q9H094 633 aa24.13■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 NAPBQ9H115 298 aa24.13■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 DDIT3P35638 169 aa24.13■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.12■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.12■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.12■■□□□ 1.45
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HDDC3-202ENST00000394272 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.12■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 G3V3G9 751 aa24.11■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.11■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.11■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 PSMD1Q99460 953 aa24.11■■□□□ 1.45
HDDC3-202ENST00000394272 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.11■■□□□ 1.45
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