RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361029.8

TRDN-202, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 5

Gene TRDN, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-202ENST00000361029 PRR19A6NJB7 356 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 B3GALT4O96024 378 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 TMC1Q8TDI8 760 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 COBLO75128 1261 aa9.56□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 CTSBP07858 339 aa9.56□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 DRD2P14416 443 aa9.56□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.56□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 ABCB6Q9NP58 842 aa9.56□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 CYP11A1P05108 521 aa9.55□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 MAOBP27338 520 aa9.55□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 POU4F3Q15319 338 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 CSRNP1Q96S65 589 aa9.54□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 BRD1O95696 1058 aa9.53□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.53□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.53□□□□□ -0.88
TRDN-202ENST00000361029 ECEL1O95672 775 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 ADH5P11766 374 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 SPINK2P20155 84 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 RXRBP28702 533 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 TMC7Q7Z402 723 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 MFSD14AQ96MC6 490 aa9.52□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 WDR64B1ANS9 1081 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 GRIK1P39086 918 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 GRM2Q14416 872 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.51□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 USP11P51784 963 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 CORO1BQ9BR76 489 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.5□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 F13BP05160 661 aa9.49□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 FAAP100Q0VG06 881 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 NFKBIBQ15653 356 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 PAOXQ6QHF9 649 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 DTX1Q86Y01 620 aa9.48□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 AP3B2Q13367 1082 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 DSC3Q14574 896 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 SHISA5Q8N114 240 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 FBXL6Q8N531 539 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 PIM2Q9P1W9 311 aa9.47□□□□□ -0.89
TRDN-202ENST00000361029 ADAMTS4O75173 837 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 PI16Q6UXB8 463 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 RAD18Q9NS91 495 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.46□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 WDR18Q9BV38 432 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 ATG3Q9NT62 314 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.45□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 TREHO43280 583 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 AOC2O75106 756 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 ADMP35318 185 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 DYMQ7RTS9 669 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 ZAR1Q86SH2 424 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 GATA6Q92908 595 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.44□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 NFICP08651 508 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 MAPK1P28482 360 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 PDE3AQ14432 1141 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.43□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 FOSL1P15407 271 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 RAB6AP20340 208 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 FCGRTP55899 365 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 PLCB3Q01970 1234 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 MAP7Q14244 749 aa9.42□□□□□ -0.9
TRDN-202ENST00000361029 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms