RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYM6O95789 1325 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 LRP5O75197 1615 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 FGFR2P21802 821 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 FSIP1Q8NA03 581 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SLC5A1P13866 664 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PDE6AP16499 860 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 CDC25BP30305 580 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM87BQ96K49 555 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ANO10Q9NW15 660 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PHKA1P46020 1223 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SARM1Q6SZW1 724 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 APPP05067 770 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 STK38Q15208 465 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 IQCB1Q15051 598 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 DRC7Q8IY82 874 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 AIDAQ96BJ3 306 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 MAP7D2Q96T17 732 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K12Q12852 859 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF3Q9H094 633 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PARP10Q53GL7 1025 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA5Q8NB90 893 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PPFIA3O75145 1194 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SPTLC2O15270 562 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 BECN2A8MW95 431 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 PTGS1P23219 599 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 SDF4Q9BRK5 362 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CLIC4Q9Y696 253 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 RTL9Q8NET4 1388 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 SUSD4Q5VX71 490 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 APOA5Q6Q788 366 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 C4AP0C0L4 1744 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 C4BP0C0L5 1744 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 GNAT2P19087 354 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 ANO1Q5XXA6 986 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 LIFRP42702 1097 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB43O43298 467 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 ALG1Q9BT22 464 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 NAPBQ9H115 298 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 B4E1Z4 1266 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 NEMFO60524 1076 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 KRT23Q9C075 422 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 CMA1P23946 247 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS1-201ENST00000311008 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms