RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 ARMT1Q9H993 441 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 NPHP1O15259 732 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 ANTXR2P58335 489 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.29■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 CTDNEP1O95476 244 aa22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 GNAT2P19087 354 aa22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 TRDNQ13061 729 aa22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 VPS37DQ86XT2 251 aa22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.28■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.27■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 SEMA3EO15041 775 aa22.27■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM37O94972 964 aa22.27■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
GDPD1-201ENST00000284116 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.27■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 CNBD1Q8NA66 436 aa22.27■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 CYP7A1P22680 504 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 LCORLQ8N3X6 602 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 DDX11Q96FC9 970 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NAPBQ9H115 298 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 ABCF2Q9UG63 623 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 CHD4Q14839 1912 aa22.26■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 GYS1P13807 737 aa22.25■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.25■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 KLRK1P26718 216 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 FERMT3Q86UX7 667 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 RAI14Q9P0K7 980 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 CACNA1SQ13698 1873 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 FIBPO43427 364 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 PRKAB2O43741 272 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 UBE2HP62256 183 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 KIF3AQ9Y496 699 aa22.24■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.23■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 ZBTB22O15209 634 aa22.23■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 GRAPQ13588 217 aa22.23■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 H3BQV1 296 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 KRT85P78386 507 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 IFFO2Q5TF58 517 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.22■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 B4E1Z4 1266 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 RESTQ13127 1097 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 PANK2Q9BZ23 570 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 NEDD4P46934 1319 aa22.21■■□□□ 1.15
GDPD1-201ENST00000284116 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 SERPINB2P05120 415 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 TXNRD1Q16881 649 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 PROM2Q8N271 834 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 TMEM87BQ96K49 555 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 TDO2P48775 406 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.2■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.19■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.19■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.19■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 INCENPQ9NQS7 918 aa22.19■■□□□ 1.14
GDPD1-201ENST00000284116 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 408.9 ms