RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-201ENST00000262291 CTDNEP1O95476 244 aa16.01■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ANTXR2P58335 489 aa16.01■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.01■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 LCORLQ8N3X6 602 aa16.01■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.01■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SMIM22K7EJ46 135 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RXRAP19793 462 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NFIXQ14938 502 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TPTE2Q6XPS3 522 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RAI14Q9P0K7 980 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RTL9Q8NET4 1388 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 B4E1Z4 1266 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 PFKFB2O60825 505 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SENP2Q9HC62 589 aa16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NHSQ6T4R5 1651 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NYXQ9GZU5 481 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.99■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CYP7A1P22680 504 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NCOA7Q8NI08 942 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NEDD4P46934 1319 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 H3BQV1 296 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 IFFO2Q5TF58 517 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RBSNQ9H1K0 784 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ATRNO75882 1429 aa15.98■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 MCM5P33992 734 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 RNF214Q8ND24 703 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SDR42E1Q8WUS8 393 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 NAPBQ9H115 298 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TOMM22Q9NS69 142 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SCN7AQ01118 1682 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 MBD3O95983 291 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TICAM2Q86XR7 235 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 LAMB2P55268 1798 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CASZ1Q86V15 1759 aa15.97■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 GSG1L2A8MUP6 293 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 PDCP20941 246 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 MYL10Q9BUA6 226 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 SBF2Q86WG5 1849 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TM4SF1P30408 202 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TDO2P48775 406 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ZNF445P59923 1031 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TTC6Q86TZ1 520 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.96■□□□□ 0.15
VMP1-201ENST00000262291 TRDNQ13061 729 aa15.96■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 UBE4AQ14139 1066 aa15.96■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 CNBD1Q8NA66 436 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 C4BP0C0L5 1744 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.95■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.94■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.94■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.94■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 EVX2Q03828 476 aa15.94■□□□□ 0.14
VMP1-201ENST00000262291 ZNF384Q8TF68 577 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms