RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krt24A1L317 512 aa17.48■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 InhbeO08717 350 aa17.48■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eno4Q8C042 619 aa17.48■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap58B2RW38 873 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tyro3P55144 880 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CgnP59242 1191 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc174Q3U155 467 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snx13Q6PHS6 957 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm43Q99J64 343 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gja10Q9WUS4 505 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo3bQ1EG27 1305 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp26a1O55127 497 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TrhQ62361 256 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfm5Q8BU90 496 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aox4Q3TYQ9 1336 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pram1Q6BCL1 675 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Erich6bQ9D4S6 220 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Osbpl5Q9ER64 874 aa17.47■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lmod1Q8BVA4 595 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bola3Q8CEI1 110 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krt84Q99M73 603 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TnmdQ9EP64 317 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VeztQ3ZK22 780 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krt40Q6IFX3 439 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prkag3Q8BGM7 489 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Paf1Q8K2T8 535 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc45Q9Z1X9 566 aa17.46■□□□□ 0.39
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd3dP04235 173 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bach2P97303 839 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pnma3Q8JZW8 466 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SdsQ8VBT2 327 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnn1Q9EQR3 537 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mx2Q9WVP9 655 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfyve9A2A8R0 1397 aa17.46■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf326O88291 580 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnnm2Q3TWN3 875 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q3TYL0 343 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plcd3Q8K2J0 785 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf2a1Q99PM3 378 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ly75Q60767 1723 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd63A2ARS0 390 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stat5bP42232 786 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtx1P47802 317 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adcy5P84309 1262 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap157Q0VFX2 523 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slitrk3Q810B9 980 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubn2Q80WC1 1314 aa17.45■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cntnap1O54991 1385 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prdm1Q60636 856 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hps6Q8BLY7 805 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap99A0A140LIX9 648 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Izumo3A6PWV3 263 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zkscan7E9PVW1 718 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NapbP28663 298 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Popdc2Q9ES82 367 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aknad1E9Q8N6 675 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Llgl2Q3TJ91 1027 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Washc4Q3UMB9 1173 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sept9Q80UG5 583 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bap1Q99PU7 728 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sil1Q9EPK6 465 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cxcl11Q9JHH5 100 aa17.44■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc7a3P70423 618 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Metap2O08663 478 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clec11aO88200 328 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxp1P58462 705 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pank2Q3U4S0 443 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mindy4Q3UQI9 744 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bicd2Q921C5 820 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pold4Q9CWP8 107 aa17.43■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif3aP28741 701 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppfia3P60469 1194 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrit1Q8K099 624 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FosbP13346 338 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm28047Q3US59 414 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aox3G3X982 1335 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc4a4O88343 1079 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col11a2Q64739 1736 aa17.42■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mctp1E9PV86 951 aa17.41■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl7d1P04769 244 aa17.41■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa17.41■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms