RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	LY86	O95711	162 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	WASF3	Q9UPY6	502 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CYB5B	O43169	146 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152		K7EM74	188 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152		M0R1X1	148 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	RAB29	O14966	203 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CRYAA	P02489	173 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	S100A8	P05109	93 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF134	P52741	427 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV2-5	P01817	119 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ADH4	P08319	380 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MORN2	Q502X0	79 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	BSN	Q9UPA5	3926 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087WWC5	75 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	AP4M1	O00189	453 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	YIF1A	O95070	293 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TUBG1	P23258	451 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GV90	55 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GZMH	P20718	246 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	BMP5	P22003	454 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	HTD2	P86397	168 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SSX3	Q99909	188 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SMCO3	A2RU48	225 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SLC31A2	O15432	143 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MGST3	O14880	152 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	IFNA1	P01562	189 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MAS1L	P35410	378 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CD81	P60033	236 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	KALRN	O60229	2985 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CEACAM4	O75871	244 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	IFNA10	P01566	189 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TRGC2	P03986	189 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	NDUFA6	P56556	154 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ADIRF	Q15847	76 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152		Q8TCH9	128 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SNX22	Q96L94	193 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PFDN5	Q99471	154 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	OR4A16	Q8NH70	328 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	HCFC1	P51610	2035 aa		10.85	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.84	□□□□□ -0.67

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