RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM233	B4DJY2	109 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BMM0	161 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	H2BFM	P0C1H6	154 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	DHODH	Q02127	395 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	FADD	Q13158	208 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	UNC119	Q13432	240 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	IRF3	Q14653	427 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM42	Q69YG0	159 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf173	Q96LM9	149 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	ASIC5	Q9NY37	505 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		H0YJX3	145 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		K7EQG2	157 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP8B1	O43520	1251 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	APOL3	O95236	402 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNDC12	O95881	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NAT1	P18440	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PAX9	P55771	341 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TPM4	P67936	248 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	EMX2	Q04743	252 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SPIN2A	Q99865	258 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	NEK6	Q9HC98	313 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB9B	Q9NP90	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0U1RQV5	110 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF222	A6NCQ9	220 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ORC5	O43913	435 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GMNN	O75496	209 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DHRS3	O75911	302 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	MYL2	P10916	166 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNJ3	P48549	501 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PAX5	Q02548	391 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SCARB2	Q14108	478 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS8	Q16651	343 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	C6orf183	Q5T699	404 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4K13	Q8NH42	304 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TLCD1	Q96CP7	247 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		Q96MT0	163 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR84	Q9NQS5	396 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WYN8	130 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NIN4	97 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC42EP2	O14613	210 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DHFR	P00374	187 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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