RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	MIDN	Q504T8	468 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	TEX29	Q8N6K0	151 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	DDB2	Q92466	427 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392		M0R1X1	148 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	ATG12	O94817	140 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	SERPINE2	P07093	398 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		10.34	□□□□□ -0.75
CELF4-222	ENST00000601392	LINC00473	A8K010	186 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TNFSF12	O43508	249 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	HPRT1	P00492	218 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	ARG1	P05089	322 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	C4BPB	P20851	252 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	LGALS4	P56470	323 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	FGL1	Q08830	312 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SP6	Q3SY56	376 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	CHIA	Q9BZP6	476 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		10.33	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TCF21	O43680	179 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	IFNA21	P01568	189 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	VDAC1	P21796	283 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	COX7A1	P24310	79 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	RNF5	Q99942	180 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.32	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV1-69	P01742	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SLC25A6	P12236	298 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	CD1B	P29016	333 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	LPAR6	P43657	344 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	LHX4	Q969G2	390 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	RPE	Q96AT9	228 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392		H0YJW9	148 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	NPFF	O15130	113 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	FCGR3B	O75015	233 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	APOA2	P02652	100 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	RAB13	P51153	203 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	DLX1	P56177	255 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	KLRD1	Q13241	179 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.3	□□□□□ -0.76
CELF4-222	ENST00000601392	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.3	□□□□□ -0.76

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