RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.98■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 NABP2Q9BQ15 211 aa15.98■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.98■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.97■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 LY6LH3BQJ8 138 aa15.97■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.97■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.97■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 A0A1B0GU03 582 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 A0A1W2PRD5 423 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 A0A1W2PRF3 423 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 A0A1W2PRM7 423 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 MARCH11A6NNE9 402 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 ODF3BA8MYP8 253 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 H0YJW9 148 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 CRYZL1O95825 349 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 SCGB1D2O95969 90 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 IGKV1-16P04430 117 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 P0C879 139 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 PAX8Q06710 450 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 OR4S2Q8NH73 311 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 R3HDM4Q96D70 268 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 SPIN2AQ99865 258 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 MMP24Q9Y5R2 645 aa15.96■□□□□ 0.15
PGS1-211ENST00000589425 PITX3O75364 302 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 SLC25A4P12235 298 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 SLC25A6P12236 298 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 S100A10P60903 97 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 C9orf62Q8N4C0 152 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 THAP6Q8TBB0 222 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 MBD2Q9UBB5 411 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 CACNG5Q9UF02 275 aa15.96■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 HMSDA8MTL9 139 aa15.95■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.95■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 OR5AC2Q9NZP5 309 aa15.95■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 RNF223E7ERA6 249 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 ATG12O94817 140 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 MSMBP08118 114 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 NQO2P16083 231 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 HTR1DP28221 377 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 SMCO1Q147U7 214 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 SSX9Q7RTT3 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 B4DSR2 109 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 ARPC5O15511 151 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 KCNAB3O43448 404 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 NXPH3O95157 252 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 RTL8BQ17RB0 113 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 ZNF546Q86UE3 836 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 OR1S1Q8NH92 325 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LHX4Q969G2 390 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 C1orf159Q96HA4 380 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 DPM3Q9P2X0 92 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 HSPB11Q9Y547 144 aa15.94■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LEUTXA8MZ59 168 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 H7C2Y5 167 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 K7EPK0 472 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 APOA2P02652 100 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 CXCL2P19875 107 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 ID3Q02535 119 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 MIDNQ504T8 468 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 TMEM65Q6PI78 240 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 DMBX1Q8NFW5 382 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 RPEQ96AT9 228 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 REG4Q9BYZ8 158 aa15.93■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 ST8SIA3O43173 380 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 DEDDO75618 318 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 LYL1P12980 280 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 Q96MF0 132 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 OR9G9P0C7N8 305 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 RRASP10301 218 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 PAX6P26367 422 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 UBE2E1P51965 193 aa15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PGS1-211ENST00000589425 RHOVQ96L33 236 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms