RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525358.1

EDRF1-210, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene EDRF1, Length 436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-210ENST00000525358 FXYD4P59646 89 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RTL8BQ17RB0 113 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 LIN54Q6MZP7 749 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 KLHDC1Q8N7A1 406 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 BVESQ8NE79 360 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 C5orf30Q96GV9 206 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SOSTQ9BQB4 213 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.71□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 KCNAB3O43448 404 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 NDUFA3O95167 84 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PTTG1O95997 202 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TBPP20226 339 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CNTFRP26992 372 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 LGALS7P47929 136 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 DGCR2P98153 550 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 VAX1Q5SQQ9 334 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM17Q86X19 198 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 MFSD4AQ8N468 514 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 DDB2Q92466 427 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 MOB3AQ96BX8 217 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.7□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 LINC00473A8K010 186 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 M0QYG6 137 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RRHO14718 337 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SHOXO15266 292 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 FCGR3BO75015 233 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SPDEFO95238 335 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CD3DP04234 171 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 IGKV1-16P04430 117 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CSF1P09603 554 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 GNRHRP30968 328 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 KRTAP10-3P60369 221 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PLGLAQ15195 96 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PSG5Q15238 335 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TMEM177Q53S58 311 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 KCTD9Q7L273 389 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CITED1Q99966 193 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CCDC32Q9BV29 185 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 GON7Q9BXV9 100 aa8.69□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 LINC01548A6NM66 108 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 AP4M1O00189 453 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TNFSF12O43508 249 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RAB3DO95716 219 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 HLA-DRB1P01911 266 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CD74P04233 296 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 UCP3P55916 312 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SLC35B1P78383 322 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CATR1Q13166 79 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 MEF2DQ14814 521 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PYDC2Q56P42 97 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CCDC190Q86UF4 302 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 HARBI1Q96MB7 349 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 FBXL15Q9H469 300 aa8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ATRQ13535 2644 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PSMB11A5LHX3 300 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 DISC1C4P0D8 188 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 GPR31O00270 319 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 FBXO24O75426 580 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 CRYZL1O95825 349 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 AKAIN1P0CW23 69 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 S100GP29377 79 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 ETV6P41212 452 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 KIR2DS2P43631 304 aa8.67□□□□□ -1.02
EDRF1-210ENST00000525358 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms