RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	GNB1	P62873	340 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM177	Q53S58	311 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR107	Q5VW38	600 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	LFNG	Q8NES3	379 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF5	Q99942	180 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	GON7	Q9BXV9	100 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	DIABLO	Q9NR28	239 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PABPC1-222	ENST00000523555		I3L521	148 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SHOX	O15266	292 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TNFSF12	O43508	249 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	HPGDS	O60760	199 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FCGR3B	O75015	233 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CTXN2	P0C2S0	81 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR5H8	P0DN80	308 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FCGR2C	P31995	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MYCNOS	P40205	109 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RAB9A	P51151	201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RAB25	P57735	213 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ARPC4	P59998	168 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	DEFA5	Q01523	94 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ARPC1A	Q92747	370 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM127	O75204	238 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PPY	P01298	95 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	APELA	P0DMC3	54 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ELK1	P19419	428 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FXYD4	P59646	89 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FHL3	Q13643	280 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FXYD3	Q14802	87 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	KCTD9	Q7L273	389 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR11H1	Q8NG94	326 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MS4A10	Q96PG2	267 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RAMP3	O60896	148 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	IGHV3-11	P01762	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	PMP2	P02689	132 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	NAT1	P18440	290 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC6A1	P30531	599 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	LGALS7	P47929	136 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RFX2	P48378	723 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SPCS2	Q15005	226 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CDK10	Q15131	360 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RTL8B	Q17RB0	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM65	Q6PI78	240 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MFSD4A	Q8N468	514 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR5T1	Q8NG75	326 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A087WW49	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555		E7EUB6	86 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555		K7EIL1	84 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CNIH1	O95406	144 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	APOA1	P02647	267 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RRAS	P10301	218 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	MYOD1	P15172	320 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	CBX5	P45973	191 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	RORC	P51449	518 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	SLURP1	P55000	103 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	UBE2K	P61086	200 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PABPC1-222	ENST00000523555	TNXA	Q16473	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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