RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF221Q9UK13 617 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IFITM5A6NNB3 132 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FABP7O15540 132 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CA2P00918 260 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FCGR3AP08637 254 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GADD45AP24522 165 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGSF11Q5DX21 431 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HES5Q5TA89 166 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 Q6ZS49 121 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB3CQ96E17 227 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SDHAF2Q9NX18 166 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM127O75204 238 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CD3GP09693 182 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GSTT2P0CG29 244 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GSTT2BP0CG30 244 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB6AP20340 208 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 S100A5P33763 92 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LGALS7P47929 136 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR10A3P58181 314 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VBP1P61758 197 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPS16P62249 146 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PLGLAQ15195 96 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MCFD2Q8NI22 146 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ARPC1AQ92747 370 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CLCC1Q96S66 551 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RYR2Q92736 4967 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CSMD3Q7Z407 3707 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H3BUA1 57 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 M0R1X1 148 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC25A17O43808 307 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR8U9P0C7N5 309 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPNP16150 400 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPP5CP53041 499 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NCS1P62166 190 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FXYD3Q14802 87 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM177Q53S58 311 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MFSD4AQ8N468 514 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DDB2Q92466 427 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MS4A10Q96PG2 267 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SSR3Q9UNL2 185 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PDCD5O14737 125 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SAP30O75446 220 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHV3-11P01762 117 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 APOA2P02652 100 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GNB3P16520 340 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RGS21Q2M5E4 152 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 Q6ZNX1 250 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 POC5Q8NA72 575 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AP3S1Q92572 193 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM68Q96MH6 324 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ASCL2Q99929 193 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCDC32Q9BV29 185 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR2D2Q9H210 308 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A0A0B4J203 849 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BET1O15155 118 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TPPP2P59282 170 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TNCP24821 2201 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGLV1-51P01701 117 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TRGV3P03979 118 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GP9P14770 177 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB3BP20337 219 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 Q8N1Y9 231 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR5T1Q8NG75 326 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LINC00473A8K010 186 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DTYMKP23919 212 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RORCP51449 518 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TEX45Q8NA69 505 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BVESQ8NE79 360 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CENPOQ9BU64 300 aa11.43□□□□□ -0.58
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms