RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 FABP5Q01469 135 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PLA2G7Q13093 441 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TATDN3Q17R31 274 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 BVESQ8NE79 360 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ISOC1Q96CN7 298 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 C5orf30Q96GV9 206 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RGS10O43665 173 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 DYRK1AQ13627 763 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RTL8BQ17RB0 113 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX45Q8NA69 505 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 SPATA25Q9BR10 227 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ERICH4A6NGS2 130 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 MSGN1A6NI15 193 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TRBV12-3P01733 135 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CSN3P07498 182 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 UBE2KP61086 200 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 HAGHQ16775 308 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RPEL1Q2QD12 228 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 HES5Q5TA89 166 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 OR10R2Q8NGX6 335 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 DDB2Q92466 427 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 MGLLQ99685 303 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CENPOQ9BU64 300 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 COA4Q9NYJ1 87 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB27BO00194 218 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 MFNGO00587 321 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 OR9G9P0C7N8 305 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GADD45AP24522 165 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 DUTP33316 252 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 AQP4P55087 323 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFA5Q01523 94 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PRSS8Q16651 343 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 LCN12Q6JVE5 192 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 Q6ZS49 121 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PRSS48Q7RTY5 328 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 Q8N402 240 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 SNAPC3Q92966 411 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PHB2Q99623 299 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PDCD5O14737 125 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2A4O95047 310 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GNB3P16520 340 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB6AP20340 208 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CRHBPP24387 322 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 MAFIPQ8WZ33 124 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 GINS4Q9BRT9 223 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC90BQ9GZT6 254 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TUBA4BQ9H853 241 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 PEMTQ9UBM1 199 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A0B4J203 849 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00473A8K010 186 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 AIREO43918 545 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 CRYZL1O95825 349 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 IFNA6P05013 189 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 APELAP0DMC3 54 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 TNXAQ16473 311 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A075B6Q4 140 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 SHISA3A0PJX4 238 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 IZUMO1RA6ND01 250 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 METTL21EPA6NDL7 271 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM223BA6NKX1 122 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 IFITM5A6NNB3 132 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 MAP2K4P45985 399 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 IDO2Q6ZQW0 420 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 NRG4Q8WWG1 115 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 BMPR1BO00238 502 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 MPPED1O15442 326 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 TALDO1P37837 337 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 OR10A3P58181 314 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 RHOGP84095 191 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF45Q02386 682 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP5G2Q06055 141 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 ARFRP1Q13795 201 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 CDK10Q15131 360 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 SSX1Q16384 188 aa12.57□□□□□ -0.4
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms