RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC2LH3BP13 241 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FUT6P51993 359 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 HAPLN4Q86UW8 402 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 MKXQ8IYA7 352 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF596Q8TC21 504 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF253O75346 499 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 RAC3P60763 192 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1FQ16864 119 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PXMP4Q9Y6I8 212 aa13.72□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.71□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 NBEAQ8NFP9 2946 aa13.71□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.71□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01551Q86U37 167 aa13.71□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf210Q8IVY1 113 aa13.71□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.71□□□□□ -0.21
CCSAP-204ENST00000483092 H0Y980 276 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PAFAH1B2P68402 229 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PRR31Q5SQ13 230 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF738Q8NE65 137 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.71□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 CRYABP02511 175 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 KCNMB1Q16558 191 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf128Q5T292 105 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FAM27BQ5VT28 67 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 LCN12Q6JVE5 192 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 UBALD2Q8IYN6 164 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 BORCS7Q96B45 105 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SFRP2Q96HF1 295 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM38BQ9NVV0 291 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 BET1LQ9NYM9 111 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FBXL7Q9UJT9 491 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 LCN2P80188 198 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GUCD1Q96NT3 240 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GCM1Q9NP62 436 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 NCKAP5O14513 1909 aa13.7□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DRB5Q30154 266 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GJE1A6NN92 205 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 G6PCP35575 357 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 MAJINQ3KP22 176 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FBXW9Q5XUX1 488 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GGNQ86UU5 652 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR8I2Q8N0Y5 310 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF318Q5VUA4 2279 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 NPPCP23582 126 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GNB1P62873 340 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 Q56UQ5 140 aa13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 H0Y8G0 127 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SRD5A2P31213 254 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 B3GALT5-AS1P59052 145 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 RBX1P62877 108 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PLPPR2Q96GM1 343 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ABHD14BQ96IU4 210 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 UHRF2Q96PU4 802 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 C12orf49Q9H741 205 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR2W1Q9Y3N9 320 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SYNGR3O43761 229 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 MGST1P10620 155 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 LYG1Q8N1E2 194 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.68□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf49A4QMS7 147 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 TUSC5Q8IXB3 177 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 OR5P3Q8WZ94 311 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 NRN1Q9NPD7 142 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF716A6NP11 495 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 A8MXE2 369 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA5P43359 124 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 RPL15P61313 204 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 PLGLB1Q02325 96 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 LTC4SQ16873 150 aa13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CCSAP-204ENST00000483092 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms