RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 DPRXA6NFQ7 191 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC16AO15027 2179 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MLNRO43193 412 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGYQ3MUY2 71 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GAPTQ8N292 157 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM186Q96B77 213 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 UHRF2Q96PU4 802 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4C12Q96R67 309 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MED12Q93074 2177 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T8A6NH00 312 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FCN1O00602 326 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CLPSP04118 112 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf79P0CE67 100 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CD99P14209 185 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 THBS3P49746 956 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOGP84095 191 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 LCN12Q6JVE5 192 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSM6Q6P461 480 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 VWA1Q6PCB0 445 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZPA2 131 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NIT1Q86X76 327 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GNB4Q9HAV0 340 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf94C9JXX5 98 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 F5H5K5 113 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NAPSAO96009 420 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KITLGP21583 273 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL1P22362 96 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IER3P46695 156 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRA2P47869 451 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF90Q03938 601 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PATE1Q8WXA2 126 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SFRP2Q96HF1 295 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFB4O95168 129 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CD59P13987 128 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GFRA1P56159 465 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NSDHLQ15738 373 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PSENENQ9NZ42 101 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE12BA1L429 117 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SNURFLB1AK76 121 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC31A1O15431 190 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GNB1P62873 340 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SAP25Q8TEE9 199 aa7.1□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 STRADBQ9C0K7 418 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 REV3LO60673 3130 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC17A3O00476 420 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TAX1BP3O14907 124 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFP01375 233 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ARR3P36575 388 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5G3P48201 142 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN18P56856 261 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CLRN1P58418 232 aa7.09□□□□□ -1.27
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