RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LOC105371242A0A075B767 164 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 WRBO00258 174 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CRYZL1O95825 349 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR9G9P0C7N8 305 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 THBS3P49746 956 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00311Q8N616 119 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR9G1Q8NH87 305 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RAB39BQ96DA2 213 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHA2Q9HB19 425 aa12.51□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IFNA7P01567 189 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LIPFP07098 398 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 COX6B1P14854 86 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 COX7A1P24310 79 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 P2RY1P47900 373 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.5□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IGSF23A1L1A6 192 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GPR137BO60478 399 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV2-5P01817 119 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1-16P04430 117 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IAPPP10997 89 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CAV2P51636 162 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR2C3Q8N628 320 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 WFDC1Q9HC57 220 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 UBQLN2Q9UHD9 624 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FBN2P35556 2912 aa12.49□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 H3BP45 60 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TOR1AO14656 332 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SYNGR2O43760 224 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6V1G1O75348 118 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LMO4P61968 165 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 VAMP2P63027 116 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LCN2P80188 198 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SPINK9Q5DT21 86 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TENM4Q6N022 2769 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PNKDQ8N490 385 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 C8orf31Q8N9H6 132 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RBKSQ9H477 322 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FBXL17Q9UF56 701 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PPH5 198 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ATG12O94817 140 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 KIR2DS2P43631 304 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR2B8PP59922 312 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 GPR157Q5UAW9 335 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 OR4S2Q8NH73 311 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ADTRPQ96IZ2 230 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 MMP26Q9NRE1 261 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 COA4Q9NYJ1 87 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TNCP24821 2201 aa12.48□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV1-47P01700 117 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NQO2P16083 231 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PDLIM4P50479 330 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ATP5J2P56134 94 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2KP61086 200 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 UBA52P62987 128 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 FAM74A1Q5RGS3 127 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM186Q96B77 213 aa12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CST7O76096 145 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 PRRX1P54821 245 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TNFRSF9Q07011 255 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 NABP2Q9BQ15 211 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 CLEC7AQ9BXN2 247 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM140Q9NV12 185 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 HSPB7Q9UBY9 170 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 ZFHX3Q15911 3703 aa12.46□□□□□ -0.41
CASQ1-201ENST00000368078 H0YJW9 148 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 H7C2Y5 167 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KRTAP10-9P60411 292 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 KLRD1Q13241 179 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HLA-DRB5Q30154 266 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SCARB1Q8WTV0 552 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PERPQ96FX8 193 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RITA1Q96K30 269 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RHOVQ96L33 236 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PSENENQ9NZ42 101 aa12.46□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms