RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS7P47929 136 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX3Q13185 183 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF562Q6V9R5 426 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R27Q86WC6 154 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PN81 502 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL24O00175 119 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHOXO15266 292 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYZL1O95825 349 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNA7P36544 502 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM65Q6PI78 240 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD9Q7L273 389 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF491Q8N8L2 437 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARPC1AQ92747 370 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNB4Q9HAV0 340 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNCP24821 2201 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A5O76082 557 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 AADACP22760 399 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR2CP31995 323 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH3B2P48448 385 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR107Q5VW38 600 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 OVCH2Q7RTZ1 564 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2E2Q96LR5 201 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGP01266 2768 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPYP01298 95 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOA1P02647 267 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB9AP51151 201 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FHL3Q13643 280 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD3Q14802 87 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 LFNGQ8NES3 379 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMTM3Q96MX0 182 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT46Q9NQC8 304 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR3BO75015 233 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2KP61086 200 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNB1P62873 340 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK10Q15131 360 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTBL2Q562R1 376 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SECTM1Q8WVN6 248 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL28Q9NRJ3 127 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSIG4Q9Y279 399 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 I3L521 148 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPGDSO60760 199 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELK1P19419 428 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RORCP51449 518 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB25P57735 213 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUNX1Q01196 453 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSMO1Q15800 293 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 VMA21Q3ZAQ7 101 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 REC114Q7Z4M0 266 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR141Q7Z602 305 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPHA2Q96T91 129 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNIH1O95406 144 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAT1P18440 290 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS3P35030 304 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX45Q8NA69 505 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5B12Q96R08 314 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD4P59646 89 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS8Q16651 343 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD4AQ8N468 514 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR11H1Q8NG94 326 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4S2Q8NH73 311 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX8Q8TED1 209 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR61Q9BZJ8 451 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms