RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 CFPP27918 469 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35B1P78383 322 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 FADS6Q8N9I5 356 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC29Q8WV35 223 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CCL17Q92583 94 aa14.57□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TOX4O94842 621 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PCP4P48539 62 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LYL1P12980 280 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CD1BP29016 333 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PSG5Q15238 335 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 C10orf128Q5T292 105 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PINLYPA6NC86 204 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 BRS3P32247 399 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.56□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 NOTCH2Q04721 2471 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CALHM1Q8IU99 346 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A6P0DMU7 189 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A5P0DMU8 189 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A7P0DMV0 189 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CREBBPQ92793 2442 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 COX7A2P2O60397 106 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LYZL4Q96KX0 146 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 U3KQA8 63 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 HELTA6NFD8 242 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CXorf1O96002 111 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 CCL1P22362 96 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TNFSF10P50591 281 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 KCNMB1Q16558 191 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 RTL8BQ17RB0 113 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 COX19Q49B96 90 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TNFRSF9Q07011 255 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 RND1Q92730 232 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PROB1E7EW31 1015 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 HAND1O96004 215 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 M0R2Z0 102 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 NEURL1O76050 574 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 IGF2RP11717 2491 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00596Q86U02 117 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LRTM2Q8N967 370 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 OR5R1Q8NH85 324 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 WBP1Q96G27 269 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 C14orf144Q96I85 54 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 IGHV2-70P01814 119 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM56Q96MV1 263 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1671Q9BY89 1806 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 AARDQ4LEZ3 155 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PRR7Q8TB68 274 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.53□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 OOEPA6NGQ2 149 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PRR33A8MZF0 331 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 AESQ08117 197 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 ZG16O60844 167 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 ID3Q02535 119 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 LYG1Q8N1E2 194 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPC1-201ENST00000273482 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 BPIFB3P59826 476 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 Q0VFX4 171 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 MISP3Q96FF7 219 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 SCGB2A2Q13296 93 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 HIST3H3Q16695 136 aa14.52□□□□□ -0.09
TRPC1-201ENST00000273482 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms