RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020258.9

Herc4-201, Transcript of Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc4, Length 3,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mdp1Q9D967 164 aa9.97□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tmem239Q9DA47 151 aa9.97□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Xcr1Q9R0M1 322 aa9.97□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Med12lQ8BQM9 2157 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm5890A0A140LI04 305 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Phlda2O08969 144 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tgfbr3O88393 850 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q3U595 105 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm21093Q6GQS8 569 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 AdoQ6PDY2 256 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scrt2Q8BTH6 311 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sp110Q8BVK9 445 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Abhd14aQ922Q6 247 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr116Q923Q6 321 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tomm20Q9DCC8 145 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp111Q9R164 701 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Efemp2Q9WVJ9 443 aa9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Herc4-201ENSMUST00000020258 Egr3P43300 387 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rab2aP53994 212 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 BaxQ07813 192 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vax1Q2NKI2 338 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Btn1a1Q62556 524 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr921Q7TRC0 313 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mrpl18Q9CQL5 180 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zdhhc22A0PK84 263 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r204I7HIK1 302 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 G530012D18RikJ3QK25 139 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Bmp8bP55105 399 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Mesp1P97309 243 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfp7Q3TFZ4 685 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 DdiasQ6NZG4 898 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ndufb8Q9D6J5 186 aa9.96□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr573-ps1A0A1B0GRU2 297 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr417F8VQB1 309 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tnfrsf26P83626 204 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tff1Q08423 87 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 PcolceQ61398 468 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Upk3bQ80YF6 275 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 FuomQ8R2K1 153 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sft2d2Q8VD57 159 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1427Q8VFU9 311 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1270Q8VGP3 304 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr979Q8VH10 311 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 BlnkQ9QUN3 457 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Srsf10Q9R0U0 262 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fzr1Q9R1K5 493 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Abca1P41233 2261 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm438B1ASB3 393 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Amy2a1E9PV85 245 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr914E9PW59 316 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm15130F6PYN5 206 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr224M9MMJ7 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Clec3bP43025 202 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Cnep1r1Q3UJ81 125 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Msl2Q69ZF8 577 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fbxo46Q8BG80 603 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Q8VCE4 163 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1412Q8VET3 321 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Wdr4Q9EP82 413 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Kcnk15B2RVL1 343 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Fabp9O08716 132 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 CrpP14847 225 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Drd3P30728 446 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Meox2P32443 303 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 St8sia5P70126 412 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ccl7Q03366 97 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tbpl2Q6SJ95 350 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Rph3alQ768S4 302 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm9837Q8C607 126 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Angptl6Q8R0Z6 457 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Scgb2b27Q8R1E9 112 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr480Q8VEZ0 312 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr508Q8VG42 310 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr1239Q8VGM8 305 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Spaca7Q9D2S4 182 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Acp1Q9D358 158 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr878Q9EQA9 314 aa9.95□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tcrg-V5A0A0G2JGV5 113 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm4881A0A140LIR9 352 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ly6g6fB2RXM6 300 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 CideaO70302 217 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tcstv1O70619 171 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Idh3gP70404 393 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Smad4P97471 551 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Olfr193Q7TS43 309 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 1810024B03RikQ8BWE1 200 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Thyn1Q91YJ3 226 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Abhd12Q99LR1 398 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Tceal8Q9CZY2 117 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Sec11cQ9D8V7 192 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Zfpl1Q9DB43 310 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 S1pr3Q9Z0U9 378 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Ctxnd2A0A1B0GQX3 59 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Vmn1r129E9QA94 307 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Gm8720K9J7F4 307 aa9.94□□□□□ -0.82
Herc4-201ENSMUST00000020258 Il11P47873 199 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.2 ms