Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Gm8720K9J7F4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gm8720K9J7F4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Gm8720K9J7F4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gm8720K9J7F4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Gm8720K9J7F4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Gm8720K9J7F4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Gm8720K9J7F4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Gm8720K9J7F4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gm8720K9J7F4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Gm8720K9J7F4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Gm8720K9J7F4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Gm8720K9J7F4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Gm8720K9J7F4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gm8720K9J7F4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Gm8720K9J7F4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gm8720K9J7F4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Gm8720K9J7F4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Gm8720K9J7F4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Gm8720K9J7F4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gm8720K9J7F4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gm8720K9J7F4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gm8720K9J7F4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gm8720K9J7F4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gm8720K9J7F4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gm8720K9J7F4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gm8720K9J7F4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
Gm8720K9J7F4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Gm8720K9J7F4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gm8720K9J7F4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm8720K9J7F4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm8720K9J7F4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Gm8720K9J7F4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Gm8720K9J7F4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Gm8720K9J7F4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Gm8720K9J7F4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Gm8720K9J7F4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Gm8720K9J7F4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Gm8720K9J7F4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Gm8720K9J7F4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Gm8720K9J7F4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Gm8720K9J7F4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Gm8720K9J7F4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,62■■□□□ 1,53
Gm8720K9J7F4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Gm8720K9J7F4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Gm8720K9J7F4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Gm8720K9J7F4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Gm8720K9J7F4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Gm8720K9J7F4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Gm8720K9J7F4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Gm8720K9J7F4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Gm8720K9J7F4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Gm8720K9J7F4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,22■■□□□ 1,47
Gm8720K9J7F4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Gm8720K9J7F4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Gm8720K9J7F4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Gm8720K9J7F4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Gm8720K9J7F4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Gm8720K9J7F4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Gm8720K9J7F4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Gm8720K9J7F4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Gm8720K9J7F4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Gm8720K9J7F4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Gm8720K9J7F4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Gm8720K9J7F4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Gm8720K9J7F4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Gm8720K9J7F4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Gm8720K9J7F4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Gm8720K9J7F4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Gm8720K9J7F4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Gm8720K9J7F4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gm8720K9J7F4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Gm8720K9J7F4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gm8720K9J7F4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Gm8720K9J7F4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Gm8720K9J7F4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Gm8720K9J7F4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Gm8720K9J7F4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Gm8720K9J7F4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Gm8720K9J7F4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Gm8720K9J7F4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Gm8720K9J7F4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gm8720K9J7F4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gm8720K9J7F4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Gm8720K9J7F4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Gm8720K9J7F4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Gm8720K9J7F4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gm8720K9J7F4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Gm8720K9J7F4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gm8720K9J7F4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gm8720K9J7F4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Gm8720K9J7F4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gm8720K9J7F4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gm8720K9J7F4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gm8720K9J7F4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gm8720K9J7F4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gm8720K9J7F4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gm8720K9J7F4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Gm8720K9J7F4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gm8720K9J7F4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100,6 ms