Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Gm438B1ASB3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gm438B1ASB3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gm438B1ASB3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gm438B1ASB3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gm438B1ASB3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gm438B1ASB3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm438B1ASB3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Gm438B1ASB3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gm438B1ASB3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Gm438B1ASB3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm438B1ASB3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gm438B1ASB3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gm438B1ASB3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gm438B1ASB3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gm438B1ASB3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm438B1ASB3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm438B1ASB3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm438B1ASB3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm438B1ASB3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm438B1ASB3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm438B1ASB3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm438B1ASB3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm438B1ASB3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm438B1ASB3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm438B1ASB3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm438B1ASB3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm438B1ASB3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm438B1ASB3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm438B1ASB3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm438B1ASB3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm438B1ASB3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm438B1ASB3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm438B1ASB3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm438B1ASB3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm438B1ASB3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm438B1ASB3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm438B1ASB3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm438B1ASB3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm438B1ASB3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm438B1ASB3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm438B1ASB3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm438B1ASB3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm438B1ASB3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm438B1ASB3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm438B1ASB3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm438B1ASB3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm438B1ASB3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm438B1ASB3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm438B1ASB3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm438B1ASB3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm438B1ASB3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm438B1ASB3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm438B1ASB3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm438B1ASB3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm438B1ASB3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm438B1ASB3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm438B1ASB3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm438B1ASB3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm438B1ASB3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm438B1ASB3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm438B1ASB3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm438B1ASB3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm438B1ASB3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm438B1ASB3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm438B1ASB3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm438B1ASB3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm438B1ASB3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm438B1ASB3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm438B1ASB3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm438B1ASB3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm438B1ASB3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm438B1ASB3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm438B1ASB3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm438B1ASB3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm438B1ASB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm438B1ASB3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm438B1ASB3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm438B1ASB3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm438B1ASB3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm438B1ASB3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm438B1ASB3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm438B1ASB3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm438B1ASB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm438B1ASB3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm438B1ASB3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm438B1ASB3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm438B1ASB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm438B1ASB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm438B1ASB3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm438B1ASB3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm438B1ASB3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm438B1ASB3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm438B1ASB3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm438B1ASB3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm438B1ASB3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm438B1ASB3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm438B1ASB3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm438B1ASB3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm438B1ASB3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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