Protein–RNA interactions for Protein: Q9R164

Zfp111, MCG22852, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp111Q9R164 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Zfp111Q9R164 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zfp111Q9R164 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zfp111Q9R164 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zfp111Q9R164 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zfp111Q9R164 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Zfp111Q9R164 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zfp111Q9R164 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp111Q9R164 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp111Q9R164 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp111Q9R164 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zfp111Q9R164 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp111Q9R164 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp111Q9R164 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfp111Q9R164 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp111Q9R164 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp111Q9R164 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp111Q9R164 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp111Q9R164 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp111Q9R164 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp111Q9R164 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfp111Q9R164 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp111Q9R164 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfp111Q9R164 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp111Q9R164 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp111Q9R164 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfp111Q9R164 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp111Q9R164 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp111Q9R164 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfp111Q9R164 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp111Q9R164 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp111Q9R164 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp111Q9R164 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp111Q9R164 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zfp111Q9R164 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp111Q9R164 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp111Q9R164 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp111Q9R164 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp111Q9R164 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp111Q9R164 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp111Q9R164 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp111Q9R164 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp111Q9R164 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp111Q9R164 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zfp111Q9R164 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfp111Q9R164 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Zfp111Q9R164 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zfp111Q9R164 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zfp111Q9R164 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zfp111Q9R164 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zfp111Q9R164 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zfp111Q9R164 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zfp111Q9R164 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zfp111Q9R164 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zfp111Q9R164 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zfp111Q9R164 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zfp111Q9R164 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Zfp111Q9R164 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zfp111Q9R164 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zfp111Q9R164 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zfp111Q9R164 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zfp111Q9R164 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zfp111Q9R164 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zfp111Q9R164 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zfp111Q9R164 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp111Q9R164 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zfp111Q9R164 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zfp111Q9R164 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Zfp111Q9R164 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zfp111Q9R164 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zfp111Q9R164 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zfp111Q9R164 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Zfp111Q9R164 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Zfp111Q9R164 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp111Q9R164 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp111Q9R164 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp111Q9R164 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp111Q9R164 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp111Q9R164 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp111Q9R164 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp111Q9R164 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp111Q9R164 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp111Q9R164 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp111Q9R164 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp111Q9R164 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp111Q9R164 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp111Q9R164 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp111Q9R164 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms