RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 KCTD9Q7L273 389 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 ENKURQ8TC29 256 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 INAFM1C9JVW0 142 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 H0YJW9 148 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TIMM23O14925 209 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 CRLF1O75462 422 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 B3GALNT1O75752 331 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SRD5A1P18405 259 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 F2RP25116 425 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 BRS3P32247 399 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 RAG2P55895 527 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 DHODHQ02127 395 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.26□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 Q6YL49 198 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 ZNF383Q8NA42 475 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 C20orf85Q9H1P6 137 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TNFSF12O43508 249 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 APOA2P02652 100 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RLN1P04808 185 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RRASP10301 218 aa9.25□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.25□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 TAS2R31P59538 309 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RGS21Q2M5E4 152 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 MOB3BQ86TA1 216 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PDPNQ86YL7 162 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 PIFOQ8TCI5 191 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.25□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 GALNT14Q96FL9 552 aa9.25□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 NUDT15Q9NV35 164 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.25□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 FAM157CP0CG43 387 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PAX6P26367 422 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 IER3P46695 156 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 C11orf88Q6PI97 169 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 PLET1Q6UQ28 207 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TMEM86BQ8N661 226 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.24□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 GPHA2Q96T91 129 aa9.24□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.23□□□□□ -0.93
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GGA3-211ENST00000582232 FAM106CPP0CH98 169 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 AKR1C4P17516 323 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RIPPLY3P57055 190 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 OXA1LQ15070 435 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 RTL8BQ17RB0 113 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TMEM177Q53S58 311 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 Q8N6K4 173 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.23□□□□□ -0.93
GGA3-211ENST00000582232 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.23□□□□□ -0.93
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