RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 DTYMKP23919 212 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 PPIFP30405 207 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 TGFBR1P36897 503 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SERPINB10P48595 397 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 MXD1Q05195 221 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 HACD4Q5VWC8 232 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 DCUN1D4Q92564 292 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SPATA2Q9UM82 520 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RAB29O14966 203 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 NBR2O15453 112 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 FABP7O15540 132 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SPNP16150 400 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR3A3P47888 321 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RAB9AP51151 201 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ACTBP60709 375 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SETD6Q8TBK2 473 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 KIAA1456Q9P272 454 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 GAB2Q9UQC2 676 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RYR2Q92736 4967 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 LINC01619G3V211 115 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ST8SIA5O15466 376 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SSX5O60225 188 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR8U9P0C7N5 309 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 GP9P14770 177 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CEACAM6P40199 344 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CDNFQ49AH0 187 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 IGSF11Q5DX21 431 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 LIN54Q6MZP7 749 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.55□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 LCE6AA0A183 80 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 OR5H14A6NHG9 310 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 GABARAPO95166 117 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA3O95167 84 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-204ENST00000403441 GSTT2BP0CG30 244 aa9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-204ENST00000403441 CT45A5P0DMU8 189 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CT45A7P0DMV0 189 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ALDH3B2P48448 385 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 SLURP1P55000 103 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 PITPNAQ00169 270 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ECSCRQ19T08 205 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 IDNKQ5T6J7 187 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 NPBQ8NG41 125 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ARPC1AQ92747 370 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CITED4Q96RK1 184 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 RDH8Q9NYR8 311 aa9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 A0A075B6Q4 140 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PN81 502 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 TMEM235A6NFC5 223 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 H0YJW9 148 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 HSPA12AO43301 675 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 TFAP2AP05549 437 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CNTFRP26992 372 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CHRNA7P36544 502 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ARFRP1Q13795 201 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 PLGLAQ15195 96 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 CTF1Q16619 201 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ACSM6Q6P461 480 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 ISOC1Q96CN7 298 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-204ENST00000403441 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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