RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.72□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 G3V318 75 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HPGDSO60760 199 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 TUSC2O75896 110 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV2-14P01704 120 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DQB1P01920 261 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 IGF1P05019 195 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 RORCP51449 518 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ARPC4P59998 168 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PLGLAQ15195 96 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PSG5Q15238 335 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 LIN54Q6MZP7 749 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 C1QL4Q86Z23 238 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 DDB2Q92466 427 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 RNF5Q99942 180 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.71□□□□□ -0.53
CSAG1-201ENST00000361211 PLXNB1O43157 2135 aa11.71□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NOTCH1P46531 2555 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV2-23P01705 113 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PF4V1P10720 104 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ELK1P19419 428 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 VDAC1P21796 283 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 AADACP22760 399 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CBX5P45973 191 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 THBS3P49746 956 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SPCS2Q15005 226 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 BVESQ8NE79 360 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CLCC1Q96S66 551 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF580Q9UK33 172 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 G3V4G9 280 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A17O43808 307 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SPDEFO95238 335 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 APOA1P02647 267 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FCGR2CP31995 323 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CX3CL1P78423 397 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TEX38Q6PEX7 206 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 COMMD1Q8N668 190 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 HARBI1Q96MB7 349 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 IFT46Q9NQC8 304 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CA2P00918 260 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 IGHG4P01861 327 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 OR5H8P0DN80 308 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FOXE3Q13461 319 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ECSCRQ19T08 205 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM177Q53S58 311 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RNF152Q8N8N0 203 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CMTM3Q96MX0 182 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GPHA2Q96T91 129 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GON7Q9BXV9 100 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CRYZL1O95825 349 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PPYP01298 95 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PF4P02776 101 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CRYGBP07316 175 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ELANEP08246 267 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PSMB8P28062 276 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS3P35030 304 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DEFA6Q01524 100 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CDK10Q15131 360 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RTL8BQ17RB0 113 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD9Q7L273 389 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GPX8Q8TED1 209 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms