RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 THBS3P49746 956 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 PPP5CP53041 499 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 TRIQKQ629K1 86 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF66Q6ZN08 573 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 BVESQ8NE79 360 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 DDB2Q92466 427 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC32Q9BV29 185 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.59□□□□□ -0.71
CCDC42-201ENST00000293845 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 MOSP00540 346 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM11P17152 192 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 HES1Q14469 280 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF846Q147U1 533 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM219Q86XT9 240 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 PDPNQ86YL7 162 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TERB2Q8NHR7 220 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 PRRT1Q99946 306 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RSRP1Q9BUV0 290 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 HRASLSQ9HDD0 168 aa10.58□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00473A8K010 186 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 GPR31O00270 319 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 APOA2P02652 100 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ECI1P42126 302 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00205P59089 165 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD9Q7L273 389 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 MRGPRFQ96AM1 343 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 M0QZK8 103 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 FGF16O43320 207 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RRASP10301 218 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 INPP1P49441 399 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 OR13C8Q8NGS7 320 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RNF5Q99942 180 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 MOB4Q9Y3A3 225 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 NAP1L6A6NFF2 107 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 H7C2Y5 167 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 IGKV1-16P04430 117 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 CRYBA1P05813 215 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 CATR1Q13166 79 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 HNF4GQ14541 408 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RTL8BQ17RB0 113 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 IDO2Q6ZQW0 420 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 MCUBQ9NWR8 336 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 C1RLQ9NZP8 487 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 PLXNB1O43157 2135 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TNFSF12O43508 249 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN9O75954 239 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFA3O95167 84 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFA7O95182 113 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 AMY1AP04745 511 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 HKR1P10072 659 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 KIR2DS2P43631 304 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RND3P61587 244 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RELBQ01201 579 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM177Q53S58 311 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf88Q6PI97 169 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf56Q8N8D9 126 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 NPBQ8NG41 125 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 OR4C13Q8NGP0 309 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 MARCH1Q8TCQ1 289 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RITA1Q96K30 269 aa10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.1 ms