RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CDK10Q15131 360 aa17.58■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 C5orf64Q2M2E5 130 aa17.58■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 OR5AU1Q8NGC0 362 aa17.58■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 LINC00527Q9UJ94 153 aa17.58■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 H7C2Y5 167 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SULT1C2O00338 296 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 TPPPO94811 219 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 DHRS11Q6UWP2 260 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SLC35E3Q7Z769 313 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 PDPNQ86YL7 162 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SLC35D1Q9NTN3 355 aa17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 NOL3O60936 208 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RBBP9O75884 186 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 PPYP01298 95 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 PMP2P02689 132 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 THBS3P49746 956 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RPL30P62888 115 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CD83Q01151 205 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 DYRK1AQ13627 763 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 MGAM2Q2M2H8 2515 aa17.56■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 FCN1O00602 326 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RRHO14718 337 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RGS5O15539 181 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 PEX14O75381 377 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 FBXO24O75426 580 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 IGLV2-23P01705 113 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DRB1P01911 266 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 BRWD1-AS2P59051 145 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 PSG5Q15238 335 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 STPG2Q8N412 459 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 BVESQ8NE79 360 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 OR52I2Q8NH67 350 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 FBXL15Q9H469 300 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CCL28Q9NRJ3 127 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 KLK11Q9UBX7 282 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 FBN3Q75N90 2809 aa17.55■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A5O76082 557 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 APOA2P02652 100 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DMAP28067 261 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 TMEM177Q53S58 311 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 ZNF329Q86UD4 541 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 EHFQ9NZC4 300 aa17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 IGF1P05019 195 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CRYGBP07316 175 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 HRH1P35367 487 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RPS16P62249 146 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 LIN54Q6MZP7 749 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 ADTRPQ96IZ2 230 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 GPHA2Q96T91 129 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SOSTQ9BQB4 213 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa17.53■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CCDC160A6NGH7 325 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 AP4M1O00189 453 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 RCVRNP35243 200 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R46P59540 309 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CFHR3Q02985 330 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 MSMO1Q15800 293 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 OR5H2Q8NGV7 314 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 CHPT1Q8WUD6 406 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 SECTM1Q8WVN6 248 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1456Q9P272 454 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 MTFP1Q9UDX5 166 aa17.52■□□□□ 0.4
SYF2-201ENST00000236273 PSMB11A5LHX3 300 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 KCNAB3O43448 404 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN15O95858 294 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 NDPQ00604 133 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 FOXRED2Q8IWF2 684 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 MFSD4AQ8N468 514 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 OR51J1Q9H342 316 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 TPSG1Q9NRR2 321 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 ZNF580Q9UK33 172 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 FBXO7Q9Y3I1 522 aa17.51■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 M0QZ24 198 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 SPDEFO95238 335 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 RRASP10301 218 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 GNRHRP30968 328 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF8P32971 234 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 LGALS7P47929 136 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 FXYD4P59646 89 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 CX3CL1P78423 397 aa17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SYF2-201ENST00000236273 DGCR2P98153 550 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms