RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000005841.15

Ctcf-201, Transcript of Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctcf, Length 3,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr987Q7TRA2 309 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 BC049730Q810N3 246 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm10600Q8BQ57 223 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Mettl9Q9EPL4 318 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm20489A2AGH5 449 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 TymsP07607 307 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 PtgfrP43117 366 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Faap24Q8BHL6 221 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 SargQ8BI29 606 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Aig1Q9D8B1 262 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Prl3c1Q9QUN5 212 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Klk4Q9Z0M1 255 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm4175D3YTW8 314 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm8265K7N6Y8 158 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Vmn1r114L7N226 321 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Vmn1r126L7N2C8 321 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Dhrs3O88876 302 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Csf3P09920 208 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ube2kP61087 200 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Coq2Q66JT7 374 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pitpnc1Q8K4R4 332 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Mpv17lQ99MS3 194 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Prg4Q9JM99 1054 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Fbxl17Q9QZN1 701 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Adamtsl5D3Z689 485 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm6526G3X9Q9 198 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Sh2b3O09039 548 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Prss46Q5M8S2 314 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Fstl4Q5STE3 841 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Prm3Q62100 101 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rtp2Q80ZI2 223 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tmem267Q8VDR5 215 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Vmn1r41Q9EQ44 310 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 VcanQ62059 3357 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Trbv29A0A0G2LB96 114 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ifna1P01572 189 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 P01728 117 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 P18528 98 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 CryabP23927 175 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Plscr4P58196 326 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pfn1P62962 140 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cln5Q3UMW8 341 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Commd3Q63829 195 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr688Q6W049 321 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr1477Q7TQQ7 315 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr1341Q7TQV4 312 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Nectin4Q8R007 508 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Utp23Q9CX11 249 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tmem175Q9CXY1 499 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Mageh1Q9NWG9 218 aa14.58□□□□□ -0.07
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pcsk5Q04592 1877 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Trav10nA0A075B622 114 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Trav10A0A075B642 114 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Fcgr4A0A0B4J1G0 249 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Ifna7P06799 190 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Cxcl1P12850 96 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm525Q3V3I5 90 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pygo2Q80V76 405 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 GhsrQ99P50 364 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tmem170aQ9D342 144 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 RprmQ9JJ72 109 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm14409A2ARR8 349 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 1700031F05RikB1AX30 191 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Tmem69Q3KQJ0 245 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 BB287469Q3UT53 144 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rnase11Q5GAM9 192 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Taar5Q5QD14 337 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Akt2Q60823 481 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 OmgQ63912 440 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Crispld2Q8BZQ2 495 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr112Q8C0S2 320 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Vmn1r70Q8R254 298 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr347Q8VGK2 312 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Abhd3Q91ZH7 411 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rab4bQ91ZR1 213 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Neurl1Q923S6 574 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gdpd3Q99LY2 330 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rpl14Q9CR57 217 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Kcnip3Q9QXT8 256 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Arpc1bQ9WV32 372 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Espl1P60330 2118 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm10037E9PX85 104 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr555E9Q547 315 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 mt-Co3P00416 261 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Sox18P43680 377 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Mdga2P60755 949 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Mfsd8Q8BH31 519 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Osbpl11Q8CI95 751 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Xrcc3Q9CXE6 349 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm21616B6ZB74 166 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm8020F6WLE9 229 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Obox6G3X9U1 347 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Olfr62L7MU75 315 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Defb4P82019 63 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Gm11110Q3U4K9 109 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 Pdzd11Q9CZG9 140 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctcf-201ENSMUST00000005841 9230110F15RikQ9D262 117 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44 ms