RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580357.1

IFT20-210, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 3

Gene IFT20, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-210	ENST00000580357	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	F2RL1	P55085	397 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ACTB	P60709	375 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NPB	Q8NG41	125 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.02	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SSX5	O60225	188 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	APOA1	P02647	267 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	CSF1	P09603	554 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SOX6	P35712	828 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SLC35B1	P78383	322 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	MMD	Q15546	238 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	MMP27	Q9H306	513 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.01	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357		H0YJW9	148 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357		H7C2Y5	167 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	AP4M1	O00189	453 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NBR2	O15453	112 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PROP1	O75360	226 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	APOA2	P02652	100 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	RRAS	P10301	218 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	CD28	P10747	220 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TMBIM6	P55061	237 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ARPC4	P59998	168 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	CD83	Q01151	205 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	CBX3	Q13185	183 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR2D2	Q9H210	308 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PSMB11	A5LHX3	300 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357		M0R1X1	148 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NDUFA3	O95167	84 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	HLA-DQB1	P01920	261 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PRSS3	P35030	304 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	LIN54	Q6MZP7	749 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PDPN	Q86YL7	162 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		12.99	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TPPP	O94811	219 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	LGALS7	P47929	136 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	THBS3	P49746	956 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TAS2R20	P59543	309 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	STPG2	Q8N412	459 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF580	Q9UK33	172 aa		12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	RRH	O14718	337 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	HLA-DRB1	P01911	266 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR5H8	P0DN80	308 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZNF383	Q8NA42	475 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	OR4F4	Q96R69	305 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	ZFP57	Q9NU63	452 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.97	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	TUSC2	O75896	110 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	SPDEF	O95238	335 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	IGF1	P05019	195 aa		12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
IFT20-210	ENST00000580357	PLGLA	Q15195	96 aa		12.96	□□□□□ -0.33

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