RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561068.5

RPS17-208, Transcript of ribosomal protein S17, human

TSL 3

Gene RPS17, Length 522 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS17-208	ENST00000561068	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SDC2	P34741	201 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	LINC00205	P59089	165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	HLA-DRB3	P79483	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CFHR3	Q02985	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	IGSF11	Q5DX21	431 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068		Q6ZS49	121 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF329	Q86UD4	541 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	TPRA1	Q86W33	373 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	STPG2	Q8N412	459 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	NPB	Q8NG41	125 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068		Q9H521	79 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	RAB9B	Q9NP90	201 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF580	Q9UK33	172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	STUB1	Q9UNE7	303 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GAB2	Q9UQC2	676 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	TRDC	B7Z8K6	153 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068		H0YJW9	148 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	FCN1	O00602	326 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	RAB29	O14966	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SSX5	O60225	188 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	RGS11	O94810	467 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	DIRAS3	O95661	229 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	FCGR3A	P08637	254 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CD3G	P09693	182 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GNB3	P16520	340 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CD36	P16671	472 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ZBTB25	P24278	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GADD45A	P24522	165 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	IL3RA	P26951	378 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	PSMB9	P28065	219 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	TGFBR1	P36897	503 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CEACAM6	P40199	344 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	RANBP1	P43487	201 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GPR12	P47775	334 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	HES1	Q14469	280 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CDNF	Q49AH0	187 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	R3HDM4	Q96D70	268 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	YIPF6	Q96EC8	236 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	CENPO	Q9BU64	300 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	GHITM	Q9H3K2	345 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RPS17-208	ENST00000561068	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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