RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	OR1E2	P47887	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CAV2	P51636	162 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	PRKCD	Q05655	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	FMOD	Q06828	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	AQP6	Q13520	282 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	TRAM2	Q15035	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ATP5S	Q99766	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A0B4J2A0	478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A0G2JND7	137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC31A2	O15432	143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2F2	O95006	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	IFNW1	P05000	195 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CRYBA1	P05813	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	RAB9A	P51151	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	GNB2	P62879	340 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ZBED5	Q49AG3	693 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR8G5	Q8NG78	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC22A4	Q9H015	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	DYSF	O75923	2080 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725		A0A087WUU8	490 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SIRPB1	O00241	398 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	MRAS	O14807	208 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NDUFA2	O43678	99 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC16A7	O60669	478 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	KRT34	O76011	436 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	NDUFB2	O95178	105 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	TSPAN13	O95857	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ALDOB	P05062	364 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	FUT3	P21217	361 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	CRABP1	P29762	137 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	LYZ	P61626	148 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF92	Q03936	586 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ECH1	Q13011	328 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	RNF212	Q495C1	297 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TMOD3-208	ENST00000560725	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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