RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560272.1

LINS1-208, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 2

Gene LINS1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-208	ENST00000560272	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	VCX	Q9H320	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272		A0A087WW49	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272		H0YJW9	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SLC22A1	O15245	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SOX15	O60248	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SPDEF	O95238	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	NAPSA	O96009	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	APOA2	P02652	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TFAP2A	P05549	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CPE	P16870	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	HTR2C	P28335	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CEACAM6	P40199	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	NDP	Q00604	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272		A0A0G2JLM5	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272		H3BUA1	57 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	FCN1	O00602	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CNIH1	O95406	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CA2	P00918	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	TRGV3	P03979	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CDK1	P06493	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	GNAO1	P09471	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	LYL1	P12980	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ARSB	P15848	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SRM	P19623	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ZP3	P21754	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CBX3	Q13185	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	UNC119	Q13432	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	INSL4	Q14641	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PSG5	Q15238	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	RCN1	Q15293	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SPHAR	Q15513	63 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	MED22	Q15528	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LINS1-208	ENST00000560272	UFD1	Q92890	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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