RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF695Q8IW36 515 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 OR6M1Q8NGM8 313 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 GALMQ96C23 342 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5B12Q96R08 314 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 CST11Q9H112 138 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 VCXQ9H320 206 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 FBXL15Q9H469 300 aa5.7□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 ZFP57Q9NU63 452 aa5.7□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 GAB2Q9UQC2 676 aa5.7□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 CEACAM6P40199 344 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 TEX38Q6PEX7 206 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 H0YJW9 148 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 REC114Q7Z4M0 266 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 RNF167Q9H6Y7 350 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 SCOCQ9UIL1 159 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF4B-208ENST00000490653 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A075B6Q4 140 aa5.67□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 TRDCB7Z8K6 153 aa5.67□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 I3L521 148 aa5.67□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 J3QRK9 145 aa5.67□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB27BO00194 218 aa5.67□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 RRHO14718 337 aa5.67□□□□□ -1.5
PRPF4B-208ENST00000490653 TXNL1O43396 289 aa5.67□□□□□ -1.5
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