RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 STUMQ69YW2 141 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 Q8IYB0 196 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR4K15Q8NH41 348 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 RAB3CQ96E17 227 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TIMD4Q96H15 378 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 NEDD4LQ96PU5 975 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TM2D1Q9BX74 207 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 ABCG5Q9H222 651 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 DIABLOQ9NR28 239 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RASL12Q9NYN1 266 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CTSZQ9UBR2 303 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GLS2Q9UI32 602 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 AK3Q9UIJ7 227 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF222Q9UK12 451 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ITPR2Q14571 2701 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 K7N7A8 449 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MFNGO00587 321 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFB3O43676 98 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRC-211ENST00000484135 SSX5O60225 188 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PDCD6O75340 191 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF737O75373 536 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 WNT2P09544 360 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CD3GP09693 182 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GIFP27352 417 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TALDO1P37837 337 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MNDAP41218 407 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 DLX1P56177 255 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 EDDM3BP56851 147 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CD81P60033 236 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LCN2P80188 198 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF79Q15937 498 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MPV17LQ2QL34 196 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 WFDC11Q8NEX6 87 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR52I2Q8NH67 350 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 THAP6Q8TBB0 222 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PTX4Q96A99 478 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SDSLQ96GA7 329 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 COQ2Q96H96 371 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NEURL2Q9BR09 285 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 KIF25Q9UIL4 384 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 V9GYH0 126 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MED13LQ71F56 2210 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 DOCK11Q5JSL3 2073 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SIGLEC5O15389 551 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3-7P01780 117 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 MT-ND4P03905 459 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CSN2P05814 226 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PAX1P15863 534 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CCL3L1P16619 93 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OMGP23515 440 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DMAP28067 261 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PRSS3P35030 304 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GNG2P59768 71 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 LMO4P61968 165 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GNB2P62879 340 aa3.83□□□□□ -1.8
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