RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSRP1Q9BUV0 290 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAB2Q9UQC2 676 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0YJW9 148 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCN1O00602 326 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB29O14966 203 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD40LGP29965 261 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LFNGQ8NES3 379 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DERL3Q96Q80 235 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT4A1Q9BR01 284 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA25Q9BR10 227 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GHRLQ9UBU3 117 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.1□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBBP9O75884 186 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA2P00918 260 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRGV3P03979 118 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MC5RP33032 325 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SVOPQ8N4V2 548 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM80Q96HE8 168 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C2Y5 167 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAP2AP05549 437 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSBP15848 533 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZP3P21754 424 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R43P59537 309 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCC1Q96S66 551 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF5Q99942 180 aa10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WXM4 84 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A1O15245 554 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSG5Q15238 335 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POC5Q8NA72 575 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETD9Q8NE22 299 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BUA1 57 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGB1BP1O14713 200 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPDEFO95238 335 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAPSAO96009 420 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBBP0CG47 229 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAGHQ16775 308 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10K2Q6IF99 312 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOB1BQ7L9L4 216 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETD6Q8TBK2 473 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THRSPQ92748 146 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGMATQ9BSE5 352 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0Y980 276 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNA6P05013 189 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD1AP06126 327 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPEP16870 476 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9G4Q8NGQ1 327 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDARADDQ8WWZ3 215 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NICN1Q9BSH3 213 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLOC1S6Q9UL45 172 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNCP24821 2201 aa10.05□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-16P04430 117 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELP19835 753 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTR2CP28335 458 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DRB3P79483 266 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST3GAL4Q11206 333 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FXYD3Q14802 87 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDPNQ86YL7 162 aa10.04□□□□□ -0.8
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGHQ92820 318 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms