RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMG1O95456 288 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV1-69P01742 117 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYBA1P05813 215 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPX1P07203 203 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRATP43155 626 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINB10P48595 397 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMP2P54851 167 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HERVK_113P63121 156 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF90Q03938 601 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGPT1Q15389 498 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC26Q2I0M4 334 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 MESTQ5EB52 335 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCN8Q6JVE9 175 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZTI0 123 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRLF3Q8IUI8 442 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 BLIDQ8IZY5 108 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYCE1Q8N0S2 351 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2D3Q8NGH3 330 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF563Q8TA94 476 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LHFPL5Q8TAF8 219 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLCD1Q96CP7 247 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL9Q9H1A3 318 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM215AQ9Y5M1 114 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL4A1P02462 1669 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTTNQ86VV8 2226 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM94Q12767 1356 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAPL1A0PJW8 107 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM213A2RRL7 107 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL15A6NJ78 407 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR11H12B2RN74 326 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3QQQ9 107 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPEO14579 308 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRASO14807 208 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCN2BO60939 215 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFB2O95178 105 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF728P0DKX0 622 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD24P25063 80 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10J1P30954 320 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CA7P43166 264 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 XCL1P47992 114 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 H2BFSP57053 126 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNAP25P60880 206 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL26P61254 145 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSP90B2PQ58FF3 399 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMTNQ6UX39 209 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPATA24Q86W54 205 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LFNGQ8NES3 379 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5L1Q8NGL2 311 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR11H2Q8NH07 326 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF13Q92913 245 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35G5Q96KT7 338 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIEN1Q9BRT3 115 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC2A9Q9NRM0 540 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARVAQ9NVD7 372 aa0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCRL2O00421 344 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORM1P02763 201 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 UCHL1P09936 223 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00614P0C842 121 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RD3LP0DJH9 198 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAP1GDS1P52306 607 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RELAQ04206 551 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS2P3Q13401 168 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf26Q17RF5 130 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM31Q5JXX7 168 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LHFPL1Q86WI0 220 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 BOD1L2Q8IYS8 172 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5J2Q8NH18 312 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDND2Q8NHS1 167 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q8WTZ3 238 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPCDCQ96CD2 204 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A6EQ96DS6 147 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBP7Q96R05 134 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMM21Q9BVV7 248 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOK5Q9P104 306 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa0.73□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS12O14924 1447 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF532Q9HCE3 1301 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRGV2A0A075B6R0 118 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV41A0A0B4J266 112 aa0.72□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GVG6 124 aa0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms