RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	MFNG	O00587	321 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	IGHG2	P01859	326 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ZBTB25	P24278	435 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	R3HDM4	Q96D70	268 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	RITA1	Q96K30	269 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	RAB29	O14966	203 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OPN1MW	P04001	364 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	FCGR3A	P08637	254 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	GPR12	P47775	334 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	DEFA6	Q01524	100 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179		A0A087WXM4	84 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	FABP7	O15540	132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	KCNAB3	O43448	404 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CNTFR	P26992	372 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	TGFBR1	P36897	503 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ACTB	P60709	375 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PNKP-223	ENST00000629179	BET1	O15155	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	WIPF1	O43516	503 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	PROP1	O75360	226 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TALDO1	P37837	337 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	MMD	Q15546	238 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	STPG2	Q8N412	459 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TNC	P24821	2201 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	AP4M1	O00189	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SOX6	P35712	828 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	LINC00205	P59089	165 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	PHF21A	Q96BD5	680 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	YIPF6	Q96EC8	236 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF221	Q9UK13	617 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM235	A6NFC5	223 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179		G3V4G9	280 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179		H0YJW9	148 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	NBR2	O15453	112 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	AIRE	O43918	545 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SERPINB10	P48595	397 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SLC35B1	P78383	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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