RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CYYR1Q96J86 154 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RHOVQ96L33 236 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC29A1Q99808 456 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 STUB1Q9UNE7 303 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 A0A1W2PPK0 400 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 IRGMA1A4Y4 181 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR5H14A6NHG9 310 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RBBP9O75884 186 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 LALBAP00709 142 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CT45A6P0DMU7 189 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CT45A5P0DMU8 189 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CT45A7P0DMV0 189 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 MYL12AP19105 171 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CD40LGP29965 261 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 MC5RP33032 325 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CAPGP40121 348 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 TPPP2P59282 170 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 MS4A10Q96PG2 267 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR14A2Q96R54 314 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPATA25Q9BR10 227 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 GAB2Q9UQC2 676 aa7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 H0YJW9 148 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB29O14966 203 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ST8SIA5O15466 376 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 BAG2O95816 211 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 HMGN3Q15651 99 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 LFNGQ8NES3 379 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM46BQ96A09 425 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RNF5Q99942 180 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 GHRLQ9UBU3 117 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.56□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 LYSTQ99698 3801 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 H7C2Y5 167 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 TRGV3P03979 118 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 IFNA6P05013 189 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 TFAP2AP05549 437 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARSBP15848 533 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZP3P21754 424 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 MED21Q13503 144 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 PSG5Q15238 335 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 HAGHQ16775 308 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 TMEM80Q96HE8 168 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 DERL3Q96Q80 235 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CLCC1Q96S66 551 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 H0Y980 276 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ITGB1BP1O14713 200 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC22A1O15245 554 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 CA2P00918 260 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 UBBP0CG47 229 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 TAS2R43P59537 309 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC1-205ENST00000572656 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.54□□□□□ -1.2
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